藍星大陸遭受磁場風暴，導致環境劇變，靈氣復蘇。在天地靈氣的滋養下，人類和動物的各項身體機能被無限激發，歷經漫長的歲月洗禮，形成了靈獸和人類常年對峙，爭奪生存空間的緊張局面。為了保護家園，人類不斷發展科技與新型修煉體系，成立作戰聯盟，大力培養戰斗型人才。少年凌天是初級學府瓊海戰校年輕一輩中的佼佼者，他擁有罕見的古神血脈，身懷神秘至寶“神腦”。一天，凌天從來自未來的助手炎靈口中，得知了三年后，大陸將面臨一場重大劫難，自己也會在這場劫難中壯烈犧牲。自此之后，凌天為了人類的未來，聽從炎靈的建議，決心在三年內修煉至巔峰境界，改變一切。
