故事發(fā)生在戰(zhàn)國時(shí)代。出生于普通忍者家庭的豬名寺 亂太郎為不負(fù)父母的厚望成為精英忍者而進(jìn)入學(xué)忍術(shù)學(xué)校。在那里認(rèn)識(shí)了富商的兒子福富 しんべヱ和戰(zhàn)爭(zhēng)中喪失父母的攝津の きり丸，并成為好友，組成了三人組。每集內(nèi)容主要講述三位忍蛋（小忍者）在忍者學(xué)校所發(fā)生的趣事。電視系列劇曾先后在中國大陸、臺(tái)灣、香港播映。忍術(shù)學(xué)校的目的是培養(yǎng)小忍者。在忍術(shù)學(xué)校里有不同學(xué)科的教授，性格各異的老師 ，高年級(jí)的天才忍者，女忍者，還有忍犬ヘムヘム，古怪的校長(zhǎng)大川 平次 渦正，非常之熱鬧！亂太郎們?nèi)私M在上課和考試中常常失敗，并且總是在問為什么，但他們?nèi)詧?jiān)持著并立志成為一流的出色忍者。忍術(shù)學(xué)校的校長(zhǎng)的變幻無常，總是作出奇奇怪怪的決定，因而發(fā)生了許多有趣的故事，亂太郎等也常卷入各種各樣的事件。小忍者們充滿正義感，面對(duì)任何困難都努力解決。《忍者亂太郎》是一部日本的動(dòng)畫影集，改編自尼子騷兵衛(wèi)原作的漫畫《落第忍者亂太郎》。
