表面看來，九之瀨宙太（村瀨步配音）只是一個平凡的初中生，但實際上，他常常能夠聽到別人聽不到的聲音，這一特質困擾著他，導致他的個性十分的軟弱和自卑。一天，宙太突然被告知，他被選中成為了宇宙警探elDLIVE中的一員。實際上，有很多宇宙人潛伏在人類之中，宇宙警探就是為了維系宇宙人和人類之間的平衡所創辦的組織。就這樣，毫不起眼的宙太肩上擔負起了沉重的任務，宇宙共生體多爾（釘宮理惠配音）成為了他的搭檔。個性飛揚跋扈好勝心強的貝羅妮卡（飯田里穗配音）、成熟穩重略微有些害羞的妮諾奇嘉（Lynn配音），和宙太一起聲張正義的還有這些可愛的女孩們。
